Avec la IIIème dynastie, commence la période que les historiens ont appelé l’Ancien Empire qui dure à peu près de -2700 à -2350. Le pouvoir se déplace vers le Nord et ne reviendra vers le Sud qu’à Thèbes. Vercoutter fait peu de mention d’Abydos durant cette période.

Durant le règne d’Houni, dernier pharaon de la IIIème dynastie, plusieurs petites pyramides ont été édifiées à travers le pays, dont une à El-Amrah, à 8 km d’Abydos.  Leurs ruines n’excédent pas 6 m de haut et leur base une vingtaine de mètres de côté.  Leur destination semble obscure.  Tombes de reines ? Cénotaphes ? Représentations de la butte primordiales à côté de temples solaires ?

Il faut signaler ici que , ironie du sort, la seule représentation du roi Chéops de la IVème dynastie est une petite statue de 9 cm de haut trouvée à Abydos (voir ci-contre)  alors que les documents font état d’une statue colossale du roi de plus de 7m de haut qui a disparu. L'existence de cette statue montre qu'une certaine activité cultuelle se poursuivait à  Abydos sous le début de l'Ancien Empire.

Les fouilles de Petrie en 1902 ont produit des textes et des objets montrant qu' au moins 5 rois différents de la Vème dynastie sont  intervenus sur le site. Parmi les objets,  il a trouvé une  stèle reproduisant un décret du roi Neferikkarê qui exempte de corvée le personnel du temple d'Abydos .

.Ounas et  les textes des pyramides

Ounas régna de -2350 à -2321. C'est le dernier roi de la Vème dynastie. Sa pyramide à Saqqara devint célèbre quand Maspero en 1881 découvrit les inscriptions qui couvraient l'intérieur. Ces inscriptions constituent la version la plus ancienne des préceptes funéraires appelés "Textes des Pyramides".  Le roi y est évoqué à la fois en Osiris dans l'outre-tombe et en fils de Rê dans le ciel. Le caractère archaïque du texte laisse à penser qu'il remonte par tradition orale au moins à la IIIème dynastie.